發酵指人們借助微生物在有氧或無氧條件下的生命活動來制備微生物菌體本身、或者直接代謝產物或次級代謝產物的過程。發酵有時也寫作酦酵，其定義由使用場合的不同而不同。通常所說的發酵，多是指生物體對于有機物的某種分解過程。
生物發酵罐，指工業上用來進行微生物發酵的裝置。其主體一般為用不銹鋼板制成的主式圓筒，其容積在一立方米至數百立方米之間。在設計和加工中應注意結構嚴密，合理，能耐受蒸汽滅菌、有一定操作彈性、內部附件盡量減少(避免死角)、物料與能量傳遞性能強，并可進行一定調節以便于清洗、減少污染，適合于多種產品的生產以及減少能量消耗。發酵是人類較早接觸的一種生物化學反應，如今在食品工業、生物和化學工業中均有廣泛應用。其也是生物工程的基本過程，即發酵工程。對于其機理以及過程控制的研究，還在繼續。
實驗室的發酵罐發酵是工業發酵罐發酵的原型和基礎，工業發酵罐發酵是在實驗室的基礎上進行放大改進而得到的，因此做好實驗室生物發酵罐的發酵是今后投入工業生產的必經之路。
一、種子活性
種子的活性對發酵實驗的成功至關重要，菌種如果活性普遍較低，那么將無法順利完成繁殖，或者繁殖速度較慢，那么將無法達到預期的發酵效果。
在搖瓶發酵時，如果搖瓶時間過長，則會起到物極必反的效果，微生物的生長分為四個時期，分別為：調整期，對數期，穩定期，和衰亡期，微生物在對數期時繁殖效果好，如果搖瓶時間過長，在接種時微生物的發酵已經經過了對數期，那么將停止快速繁殖，其數目一般不會有太大變化，甚至還會有所減少。
二、發酵培養基
發酵培養基是供菌種生長、繁殖和合成產物之用。它既要使種子接種后能迅速生長，達到一定的菌絲濃度，又要使長好的菌體能迅速合成需產物。因此，要求發酵培養基的組成應豐富、*，碳、氮源要注意*和遲效的互相搭配，少用*營養，多加遲效營養;還要考慮適當的碳氮比，加緩沖劑穩定pH值;并且還要有菌體生長所需的生長因子和產物合成所需要的元素、前體和促進劑等。除有菌體生長所必需的元素和化合物外，還要有產物所需的特定元素、前體和促進劑等。但若因生長和生物合成產物需要的總的碳源、氮源、磷源等的濃度太高，或生長和合成兩階段各需的條件要求不同時，則可考慮培養基用分批補料來加以滿足。
三、雜菌污染
生物發酵罐進行發酵操作之前，必須進行高壓滅菌處理，以殺死罐內殘留的雜菌。有的時候雖然在高壓滅菌后消滅了發酵罐內的雜菌，但是在接種時也可能會引入新的細菌，因此接種時的無菌操作也是十分重要的一個注意點。如果在發酵操作進行時，其罐內含有雜菌，則會導致以下兩種結果：1、會對發酵所需的微生物造成不可挽回的毀滅性打擊，導致發酵所需的微生物大面積死亡，從而使整個發酵實驗以失敗告終。2、不會對發酵所需的微生物造成危害，但是其會在發酵過程中與發酵所需的微生物搶奪養分，從而在一定程度上抑制了微生物的正常生長繁殖，久而久之，還是會導致實驗走向失敗。
